Dr. Rüstem Eyüboğlu tarafından kurulan Eyüboğlu Eğitim Kurumları, eğitim
dünyasına 1970 yılında Arı Dershanesi olarak adım atmış, 1985 yılında
Dr. Eyüboğlu’nun eğitim hizmetine ortaöğretim alanında devam etme hedefi doğrultusunda Eyüboğlu Koleji kurulmuştur. 1985 yılında öğretime başlayan okul, 1988 yılında Çamlıca’da kurulan yaklaşık 33.000 m2 alana sahip kampüse taşınmıştır.
1993 yılında Eyüboğlu Fen Lisesi kurulmuş ve kampüs genişleyerek eğitim olanakları 500 kişilik tiyatro salonu ile fen ve teknoloji laboratuvarlarının bulunduğu Eyüboğlu Hall, Öğretmen Çalışma Merkezi (Teachers’ Study) ve yaklaşık 100.000 cilt Türkçe, İngilizce, Almanca, Fransızca, İtalyanca ve İspanyolca kitap ve kaynak içeren Eyüboğlu Merkez Kütüphanesi ve Medya Merkezi ile zenginleşmiştir.
1997 yılında Eyüboğlu Fen Lisesi yeni binasına geçmiş ve aynı yıl Türkiye’de ortaöğretim kurumları arasındaki ilk ve tek Gözlemevi/Uzay Araştırmaları Laboratuvarı, hizmete başlamıştır. Aynı yıl Eyüboğlu Eğitim ve Bilimsel Araştırmalar ve Eyüboğlu Eğitim, Kültür ve Sosyal Yardımlaşma Vakıfları kurulmuş ve Eyüboğlu okullarında eğitim öğretimi destekleme çalışmalarına başlamıştır.
1998 yılında Çamlıca Kampüsünde Eyüboğlu Çamlıca İlköğretim Okulu ve açık spor alanları, 9. Cumhurbaşkanı Sayın Süleyman Demirel tarafından açılarak öğretime başlamıştır.
1999 yılında Açık Spor Alanları’nın 5000 m2’lik bölümü öğrencilerin spor ve oyun etkinliklerinde kullanılması amacıyla yeşil saha olarak düzenlenmiştir.
2000 yılında özellikle ilköğretim öğrenci ve velilerinin talepleriyle Eyüboğlu II. Gözlemevi, Milli Eğitim Bakanı Sayın Metin Bostancıoğlu tarafından açılarak hizmete girmiştir.
2002 yılının yaz döneminde yapımı tamamlanan Eyüboğlu Spor ve Sanat Kompleksinde, yarı olimpik yüzme havuzu, iki adet kapalı spor salonu, okçuluk çalışma pisti, koşu pisti, drama-tiyatro salonları, koro-müzik çalışma salonları, müzik kayıt stüdyosu, halk oyunları salonu, bale-step salonu, modern dans salonu, görsel sanatlar atölyeleri ve çok amaçlı salonların yanı sıra kafeterya bulunmaktadır. Bu kompleks, teknolojinin sağladığı en üstün olanaklara sahiptir.
Okul öncesi eğitimin giderek artan önemi doğrultusunda, 2004-2005 akademik yılında Eyüboğlu Koşuyolu Anaokulu ve 2005-2006 akademik yılında da Eyüboğlu Erenköy Anaokulu eğitim-öğretime başlamıştır.
2006-2007 eğitim-öğretim yılında açılan Eyüboğlu Ataşehir İlköğretim Okulu Ataşehir’de, 2007-2008 eğitim-öğretim yılında açılan Eyüboğlu Anaokulu ise Sabancı Üniversitesi Kampüsünde eğitim-öğretime başlamıştır.
2008 yılının mart ayında Eyüboğlu Kemerburgaz Anaokulu ve İlköğretim Okulu ile 2009-2010 eğitim-öğretim yılında Eyüboğlu Batı Ataşehir Anaokulunun açılışı yapılmıştır.
2012-2013 eğitim-öğretim yılında 12 yıllık zorunlu eğitim sistemine geçilmesiyle birlikte, Eyüboğlu Çamlıca Ortaokulu ve Eyüboğlu Kemerburgaz Ortaokulu İlköğretim Okulu bünyesinden ayrılarak Ortaokul olarak eğitim-öğretim faaliyetlerine devam etmeye başlamıştır.
2014-2015 eğitim-öğretim yılında Eyüboğlu Kemerburgaz Kampüsü Gözlemevi hizmete açılmıştır.
2015-2016 eğitim-öğretim yılında açılan Burçak Eyüboğlu Batı Ataşehir Anaokulu-İlkokulu-Ortaokulu ve Eyüboğlu Ataşehir Anaokulu ve İlkokulu ile kurum bünyesinde hizmet veren okul sayısı 7 anaokulu, 3 ilkokul, 3 ortaokul, 2 lise olmak üzere 15’e yükselmiştir.